Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GAPVD1Q14C86 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms