Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GBX1Q14549 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms