Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EBI3Q14213 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms