Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ITGA9Q13797 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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