Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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IRF5Q13568 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IRF5Q13568 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IRF5Q13568 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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