Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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RPA4Q13156 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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RPA4Q13156 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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RPA4Q13156 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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