Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TRAF3Q13114 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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