Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTP4A2Q12974 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTP4A2Q12974 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTP4A2Q12974 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTP4A2Q12974 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTP4A2Q12974 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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PTP4A2Q12974 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTP4A2Q12974 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PTP4A2Q12974 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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