Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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