Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RAB40BQ12829 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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RAB40BQ12829 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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