Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms