Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PUDPQ08623 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms