Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GOLGA3Q08378 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms