Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms