Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLOD1Q02809 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms