Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC2Q02487 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms