Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPEQ02224 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms