Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms