Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5Q00535 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms