Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKOR1P84550 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKOR1P84550 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms