Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG7P83436 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG7P83436 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG7P83436 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG7P83436 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms