Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBBP68871 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBBP68871 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBBP68871 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBBP68871 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBBP68871 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBBP68871 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBBP68871 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBBP68871 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBBP68871 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBBP68871 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HBBP68871 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms