Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms