Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP46P62068 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP46P62068 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP46P62068 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP46P62068 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP46P62068 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP46P62068 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP46P62068 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP46P62068 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP46P62068 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP46P62068 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms