Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFM1P61960 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFM1P61960 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UFM1P61960 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UFM1P61960 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFM1P61960 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFM1P61960 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UFM1P61960 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms