Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVFC1P60507 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms