Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NME5P56597 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NME5P56597 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NME5P56597 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME5P56597 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.5 ms