Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOSBP53539 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOSBP53539 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOSBP53539 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms