Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP98P52948 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP98P52948 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP98P52948 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP98P52948 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP98P52948 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP98P52948 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms