Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms