Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms