Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPR4P46093 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPR4P46093 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GPR4P46093 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GPR4P46093 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GPR4P46093 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPR4P46093 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPR4P46093 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms