Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms