Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GATA4P43694 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA4P43694 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA4P43694 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA4P43694 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GATA4P43694 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms