Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPARGP37231 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms