Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP5C1P36542 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms