Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDIT3P35638 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDIT3P35638 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms