Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms