Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-FP30511 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-FP30511 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms