Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms