Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCAP28676 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCAP28676 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCAP28676 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GCAP28676 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms