Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms