Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSFA2P28290 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms