Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms