Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2AP24928 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2AP24928 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms