Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms