Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPA1P15085 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPA1P15085 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPA1P15085 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPA1P15085 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPA1P15085 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms