Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms