Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms