Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PKHD1P08F94 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PKHD1P08F94 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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